Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms