Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTCH4Q99466 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms