Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms