Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms