Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms