Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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ZNF248Q8NDW4 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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ZNF248Q8NDW4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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