Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms