Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms