Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms