Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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CLDN19Q8N6F1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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