Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms