Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC36A4Q6YBV0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC36A4Q6YBV0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms