Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms