Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIRMAQ69YN4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms