Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms