Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms