Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF827Q17R98 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms