Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms