Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FXNQ16595 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FXNQ16595 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FXNQ16595 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FXNQ16595 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FXNQ16595 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FXNQ16595 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FXNQ16595 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FXNQ16595 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FXNQ16595 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FXNQ16595 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FXNQ16595 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms