Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms