Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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