Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms