Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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