Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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SIX1Q15475 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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SIX1Q15475 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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SIX1Q15475 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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SIX1Q15475 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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SIX1Q15475 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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