Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms