Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms