Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms