Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLAMF1Q13291 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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