Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms