Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms