Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms