Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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