Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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FOXF2Q12947 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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FOXF2Q12947 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FOXF2Q12947 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FOXF2Q12947 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FOXF2Q12947 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FOXF2Q12947 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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