Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms