Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID5AQ03989 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms