Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms