Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTCQ00610 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms