Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms