Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CABP4P57796 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CABP4P57796 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CABP4P57796 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CABP4P57796 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CABP4P57796 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CABP4P57796 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CABP4P57796 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CABP4P57796 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CABP4P57796 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CABP4P57796 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CABP4P57796 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CABP4P57796 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CABP4P57796 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CABP4P57796 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CABP4P57796 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CABP4P57796 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms