Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCBP4P57723 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms