Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC13P55735 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC13P55735 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC13P55735 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC13P55735 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC13P55735 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC13P55735 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC13P55735 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC13P55735 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC13P55735 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC13P55735 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC13P55735 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC13P55735 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC13P55735 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC13P55735 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC13P55735 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC13P55735 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC13P55735 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC13P55735 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC13P55735 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC13P55735 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC13P55735 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC13P55735 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC13P55735 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC13P55735 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC13P55735 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC13P55735 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC13P55735 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC13P55735 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC13P55735 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms