Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A2P55011 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms