Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR5P51681 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR5P51681 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR5P51681 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR5P51681 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR5P51681 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR5P51681 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR5P51681 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR5P51681 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR5P51681 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR5P51681 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR5P51681 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCR5P51681 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR5P51681 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR5P51681 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR5P51681 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR5P51681 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR5P51681 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR5P51681 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR5P51681 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms