Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIP4K2AP48426 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIP4K2AP48426 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIP4K2AP48426 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIP4K2AP48426 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIP4K2AP48426 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIP4K2AP48426 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIP4K2AP48426 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIP4K2AP48426 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIP4K2AP48426 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PIP4K2AP48426 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PIP4K2AP48426 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PIP4K2AP48426 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIP4K2AP48426 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms