Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZBP47756 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPZBP47756 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms