Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATRXP46100 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATRXP46100 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRXP46100 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRXP46100 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRXP46100 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRXP46100 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRXP46100 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRXP46100 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRXP46100 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRXP46100 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRXP46100 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRXP46100 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRXP46100 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRXP46100 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRXP46100 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRXP46100 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRXP46100 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRXP46100 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATRXP46100 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms