Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGP37231 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGP37231 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms