Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms