Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms