Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms